Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCG3Q8WXD2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms