Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB9

RHBDD1, Rhomboid-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1Q8TEB9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RHBDD1Q8TEB9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
RHBDD1Q8TEB9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDD1Q8TEB9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDD1Q8TEB9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDD1Q8TEB9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDD1Q8TEB9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDD1Q8TEB9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDD1Q8TEB9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDD1Q8TEB9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDD1Q8TEB9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RHBDD1Q8TEB9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHBDD1Q8TEB9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RHBDD1Q8TEB9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHBDD1Q8TEB9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDD1Q8TEB9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDD1Q8TEB9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDD1Q8TEB9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDD1Q8TEB9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDD1Q8TEB9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDD1Q8TEB9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDD1Q8TEB9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDD1Q8TEB9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDD1Q8TEB9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDD1Q8TEB9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDD1Q8TEB9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDD1Q8TEB9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDD1Q8TEB9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDD1Q8TEB9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDD1Q8TEB9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDD1Q8TEB9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDD1Q8TEB9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDD1Q8TEB9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDD1Q8TEB9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDD1Q8TEB9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDD1Q8TEB9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDD1Q8TEB9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDD1Q8TEB9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDD1Q8TEB9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDD1Q8TEB9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDD1Q8TEB9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDD1Q8TEB9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHBDD1Q8TEB9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.6 ms