Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HELQQ8TDG4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HELQQ8TDG4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HELQQ8TDG4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HELQQ8TDG4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HELQQ8TDG4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HELQQ8TDG4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HELQQ8TDG4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HELQQ8TDG4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HELQQ8TDG4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HELQQ8TDG4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HELQQ8TDG4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HELQQ8TDG4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HELQQ8TDG4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HELQQ8TDG4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HELQQ8TDG4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HELQQ8TDG4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HELQQ8TDG4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HELQQ8TDG4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HELQQ8TDG4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HELQQ8TDG4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HELQQ8TDG4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HELQQ8TDG4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HELQQ8TDG4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HELQQ8TDG4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HELQQ8TDG4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HELQQ8TDG4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HELQQ8TDG4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HELQQ8TDG4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HELQQ8TDG4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HELQQ8TDG4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HELQQ8TDG4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HELQQ8TDG4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HELQQ8TDG4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HELQQ8TDG4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HELQQ8TDG4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HELQQ8TDG4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HELQQ8TDG4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.2 ms