Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC148Q8NFR7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC148Q8NFR7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC148Q8NFR7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC148Q8NFR7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC148Q8NFR7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC148Q8NFR7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC148Q8NFR7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC148Q8NFR7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC148Q8NFR7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC148Q8NFR7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC148Q8NFR7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC148Q8NFR7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC148Q8NFR7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC148Q8NFR7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC148Q8NFR7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC148Q8NFR7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC148Q8NFR7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC148Q8NFR7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC148Q8NFR7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC148Q8NFR7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC148Q8NFR7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC148Q8NFR7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC148Q8NFR7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC148Q8NFR7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC148Q8NFR7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC148Q8NFR7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC148Q8NFR7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC148Q8NFR7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC148Q8NFR7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC148Q8NFR7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC148Q8NFR7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC148Q8NFR7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC148Q8NFR7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC148Q8NFR7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC148Q8NFR7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC148Q8NFR7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC148Q8NFR7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC148Q8NFR7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC148Q8NFR7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC148Q8NFR7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC148Q8NFR7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC148Q8NFR7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC148Q8NFR7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC148Q8NFR7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC148Q8NFR7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC148Q8NFR7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC148Q8NFR7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC148Q8NFR7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC148Q8NFR7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC148Q8NFR7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC148Q8NFR7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC148Q8NFR7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC148Q8NFR7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC148Q8NFR7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC148Q8NFR7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC148Q8NFR7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC148Q8NFR7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC148Q8NFR7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC148Q8NFR7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC148Q8NFR7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC148Q8NFR7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC148Q8NFR7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC148Q8NFR7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC148Q8NFR7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC148Q8NFR7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC148Q8NFR7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC148Q8NFR7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC148Q8NFR7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC148Q8NFR7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC148Q8NFR7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC148Q8NFR7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC148Q8NFR7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC148Q8NFR7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC148Q8NFR7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC148Q8NFR7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC148Q8NFR7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC148Q8NFR7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC148Q8NFR7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC148Q8NFR7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC148Q8NFR7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC148Q8NFR7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC148Q8NFR7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC148Q8NFR7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC148Q8NFR7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC148Q8NFR7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC148Q8NFR7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC148Q8NFR7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC148Q8NFR7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC148Q8NFR7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC148Q8NFR7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC148Q8NFR7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC148Q8NFR7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC148Q8NFR7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC148Q8NFR7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC148Q8NFR7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC148Q8NFR7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC148Q8NFR7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC148Q8NFR7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC148Q8NFR7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms