Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHDC9Q8NEP7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHDC9Q8NEP7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHDC9Q8NEP7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHDC9Q8NEP7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHDC9Q8NEP7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHDC9Q8NEP7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHDC9Q8NEP7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHDC9Q8NEP7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHDC9Q8NEP7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHDC9Q8NEP7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHDC9Q8NEP7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHDC9Q8NEP7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHDC9Q8NEP7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHDC9Q8NEP7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KLHDC9Q8NEP7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KLHDC9Q8NEP7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KLHDC9Q8NEP7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26■■□□□ 1.75
KLHDC9Q8NEP7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KLHDC9Q8NEP7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KLHDC9Q8NEP7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
KLHDC9Q8NEP7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
KLHDC9Q8NEP7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KLHDC9Q8NEP7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHDC9Q8NEP7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHDC9Q8NEP7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHDC9Q8NEP7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHDC9Q8NEP7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHDC9Q8NEP7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHDC9Q8NEP7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHDC9Q8NEP7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHDC9Q8NEP7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHDC9Q8NEP7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHDC9Q8NEP7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHDC9Q8NEP7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHDC9Q8NEP7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHDC9Q8NEP7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHDC9Q8NEP7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHDC9Q8NEP7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHDC9Q8NEP7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHDC9Q8NEP7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHDC9Q8NEP7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHDC9Q8NEP7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHDC9Q8NEP7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHDC9Q8NEP7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHDC9Q8NEP7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHDC9Q8NEP7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHDC9Q8NEP7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHDC9Q8NEP7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHDC9Q8NEP7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHDC9Q8NEP7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KLHDC9Q8NEP7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
KLHDC9Q8NEP7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHDC9Q8NEP7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHDC9Q8NEP7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHDC9Q8NEP7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHDC9Q8NEP7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHDC9Q8NEP7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHDC9Q8NEP7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHDC9Q8NEP7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHDC9Q8NEP7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHDC9Q8NEP7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHDC9Q8NEP7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHDC9Q8NEP7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHDC9Q8NEP7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHDC9Q8NEP7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHDC9Q8NEP7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHDC9Q8NEP7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KLHDC9Q8NEP7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KLHDC9Q8NEP7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KLHDC9Q8NEP7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KLHDC9Q8NEP7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KLHDC9Q8NEP7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KLHDC9Q8NEP7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KLHDC9Q8NEP7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KLHDC9Q8NEP7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KLHDC9Q8NEP7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KLHDC9Q8NEP7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KLHDC9Q8NEP7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KLHDC9Q8NEP7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KLHDC9Q8NEP7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHDC9Q8NEP7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHDC9Q8NEP7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHDC9Q8NEP7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHDC9Q8NEP7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHDC9Q8NEP7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHDC9Q8NEP7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHDC9Q8NEP7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHDC9Q8NEP7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHDC9Q8NEP7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHDC9Q8NEP7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KLHDC9Q8NEP7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KLHDC9Q8NEP7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
KLHDC9Q8NEP7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KLHDC9Q8NEP7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KLHDC9Q8NEP7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KLHDC9Q8NEP7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KLHDC9Q8NEP7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHDC9Q8NEP7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHDC9Q8NEP7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms