Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK8

FAM46D, Putative nucleotidyltransferase FAM46D, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46DQ8NEK8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM46DQ8NEK8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM46DQ8NEK8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM46DQ8NEK8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM46DQ8NEK8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM46DQ8NEK8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM46DQ8NEK8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM46DQ8NEK8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM46DQ8NEK8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM46DQ8NEK8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM46DQ8NEK8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM46DQ8NEK8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM46DQ8NEK8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM46DQ8NEK8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM46DQ8NEK8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM46DQ8NEK8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM46DQ8NEK8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM46DQ8NEK8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM46DQ8NEK8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM46DQ8NEK8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM46DQ8NEK8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM46DQ8NEK8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM46DQ8NEK8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM46DQ8NEK8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM46DQ8NEK8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM46DQ8NEK8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM46DQ8NEK8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM46DQ8NEK8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM46DQ8NEK8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM46DQ8NEK8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM46DQ8NEK8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM46DQ8NEK8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM46DQ8NEK8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM46DQ8NEK8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM46DQ8NEK8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM46DQ8NEK8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM46DQ8NEK8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM46DQ8NEK8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM46DQ8NEK8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM46DQ8NEK8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM46DQ8NEK8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM46DQ8NEK8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM46DQ8NEK8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms