Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF9

SRFBP1, Serum response factor-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRFBP1Q8NEF9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRFBP1Q8NEF9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SRFBP1Q8NEF9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRFBP1Q8NEF9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRFBP1Q8NEF9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SRFBP1Q8NEF9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRFBP1Q8NEF9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRFBP1Q8NEF9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRFBP1Q8NEF9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRFBP1Q8NEF9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRFBP1Q8NEF9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRFBP1Q8NEF9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRFBP1Q8NEF9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SRFBP1Q8NEF9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SRFBP1Q8NEF9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRFBP1Q8NEF9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRFBP1Q8NEF9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRFBP1Q8NEF9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRFBP1Q8NEF9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRFBP1Q8NEF9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRFBP1Q8NEF9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRFBP1Q8NEF9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRFBP1Q8NEF9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRFBP1Q8NEF9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRFBP1Q8NEF9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRFBP1Q8NEF9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRFBP1Q8NEF9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRFBP1Q8NEF9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRFBP1Q8NEF9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRFBP1Q8NEF9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRFBP1Q8NEF9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRFBP1Q8NEF9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRFBP1Q8NEF9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRFBP1Q8NEF9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRFBP1Q8NEF9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRFBP1Q8NEF9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRFBP1Q8NEF9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRFBP1Q8NEF9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRFBP1Q8NEF9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRFBP1Q8NEF9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SRFBP1Q8NEF9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRFBP1Q8NEF9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRFBP1Q8NEF9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRFBP1Q8NEF9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRFBP1Q8NEF9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms