Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF248Q8NDW4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF248Q8NDW4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF248Q8NDW4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF248Q8NDW4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF248Q8NDW4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF248Q8NDW4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF248Q8NDW4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF248Q8NDW4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF248Q8NDW4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF248Q8NDW4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF248Q8NDW4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF248Q8NDW4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF248Q8NDW4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF248Q8NDW4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF248Q8NDW4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF248Q8NDW4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF248Q8NDW4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF248Q8NDW4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF248Q8NDW4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF248Q8NDW4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF248Q8NDW4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF248Q8NDW4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF248Q8NDW4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF248Q8NDW4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF248Q8NDW4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF248Q8NDW4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF248Q8NDW4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF248Q8NDW4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF248Q8NDW4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF248Q8NDW4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF248Q8NDW4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF248Q8NDW4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF248Q8NDW4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF248Q8NDW4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF248Q8NDW4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF248Q8NDW4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF248Q8NDW4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF248Q8NDW4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF248Q8NDW4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF248Q8NDW4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF248Q8NDW4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF248Q8NDW4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF248Q8NDW4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF248Q8NDW4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms