Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CARMIL3Q8ND23 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CARMIL3Q8ND23 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CARMIL3Q8ND23 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CARMIL3Q8ND23 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARMIL3Q8ND23 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARMIL3Q8ND23 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARMIL3Q8ND23 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARMIL3Q8ND23 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARMIL3Q8ND23 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CARMIL3Q8ND23 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CARMIL3Q8ND23 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARMIL3Q8ND23 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CARMIL3Q8ND23 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CARMIL3Q8ND23 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CARMIL3Q8ND23 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CARMIL3Q8ND23 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CARMIL3Q8ND23 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CARMIL3Q8ND23 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CARMIL3Q8ND23 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CARMIL3Q8ND23 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CARMIL3Q8ND23 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CARMIL3Q8ND23 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CARMIL3Q8ND23 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CARMIL3Q8ND23 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CARMIL3Q8ND23 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CARMIL3Q8ND23 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CARMIL3Q8ND23 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CARMIL3Q8ND23 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CARMIL3Q8ND23 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CARMIL3Q8ND23 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CARMIL3Q8ND23 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CARMIL3Q8ND23 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CARMIL3Q8ND23 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CARMIL3Q8ND23 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CARMIL3Q8ND23 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CARMIL3Q8ND23 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CARMIL3Q8ND23 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CARMIL3Q8ND23 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CARMIL3Q8ND23 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CARMIL3Q8ND23 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CARMIL3Q8ND23 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARMIL3Q8ND23 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARMIL3Q8ND23 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARMIL3Q8ND23 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARMIL3Q8ND23 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARMIL3Q8ND23 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARMIL3Q8ND23 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CARMIL3Q8ND23 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CARMIL3Q8ND23 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CARMIL3Q8ND23 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CARMIL3Q8ND23 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CARMIL3Q8ND23 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CARMIL3Q8ND23 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CARMIL3Q8ND23 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CARMIL3Q8ND23 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CARMIL3Q8ND23 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CARMIL3Q8ND23 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CARMIL3Q8ND23 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CARMIL3Q8ND23 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CARMIL3Q8ND23 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CARMIL3Q8ND23 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CARMIL3Q8ND23 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CARMIL3Q8ND23 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CARMIL3Q8ND23 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CARMIL3Q8ND23 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CARMIL3Q8ND23 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CARMIL3Q8ND23 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CARMIL3Q8ND23 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CARMIL3Q8ND23 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CARMIL3Q8ND23 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CARMIL3Q8ND23 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CARMIL3Q8ND23 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CARMIL3Q8ND23 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
CARMIL3Q8ND23 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CARMIL3Q8ND23 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CARMIL3Q8ND23 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CARMIL3Q8ND23 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CARMIL3Q8ND23 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CARMIL3Q8ND23 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CARMIL3Q8ND23 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CARMIL3Q8ND23 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CARMIL3Q8ND23 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CARMIL3Q8ND23 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARMIL3Q8ND23 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARMIL3Q8ND23 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARMIL3Q8ND23 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARMIL3Q8ND23 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARMIL3Q8ND23 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARMIL3Q8ND23 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARMIL3Q8ND23 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARMIL3Q8ND23 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARMIL3Q8ND23 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARMIL3Q8ND23 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARMIL3Q8ND23 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARMIL3Q8ND23 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARMIL3Q8ND23 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARMIL3Q8ND23 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARMIL3Q8ND23 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARMIL3Q8ND23 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms