Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZIC4Q8N9L1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZIC4Q8N9L1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZIC4Q8N9L1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZIC4Q8N9L1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZIC4Q8N9L1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZIC4Q8N9L1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZIC4Q8N9L1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZIC4Q8N9L1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZIC4Q8N9L1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZIC4Q8N9L1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZIC4Q8N9L1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZIC4Q8N9L1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZIC4Q8N9L1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZIC4Q8N9L1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZIC4Q8N9L1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZIC4Q8N9L1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZIC4Q8N9L1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZIC4Q8N9L1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZIC4Q8N9L1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZIC4Q8N9L1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZIC4Q8N9L1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZIC4Q8N9L1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZIC4Q8N9L1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZIC4Q8N9L1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZIC4Q8N9L1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZIC4Q8N9L1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZIC4Q8N9L1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZIC4Q8N9L1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZIC4Q8N9L1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZIC4Q8N9L1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZIC4Q8N9L1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ZIC4Q8N9L1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZIC4Q8N9L1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZIC4Q8N9L1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZIC4Q8N9L1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZIC4Q8N9L1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZIC4Q8N9L1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZIC4Q8N9L1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZIC4Q8N9L1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZIC4Q8N9L1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZIC4Q8N9L1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZIC4Q8N9L1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZIC4Q8N9L1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms