Protein–RNA interactions for Protein: Q8N815

CNTD1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD1Q8N815 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTD1Q8N815 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTD1Q8N815 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTD1Q8N815 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
CNTD1Q8N815 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTD1Q8N815 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTD1Q8N815 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTD1Q8N815 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTD1Q8N815 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTD1Q8N815 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTD1Q8N815 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTD1Q8N815 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTD1Q8N815 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTD1Q8N815 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTD1Q8N815 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTD1Q8N815 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTD1Q8N815 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTD1Q8N815 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTD1Q8N815 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTD1Q8N815 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTD1Q8N815 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTD1Q8N815 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTD1Q8N815 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTD1Q8N815 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTD1Q8N815 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTD1Q8N815 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTD1Q8N815 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTD1Q8N815 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTD1Q8N815 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTD1Q8N815 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTD1Q8N815 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTD1Q8N815 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTD1Q8N815 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTD1Q8N815 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTD1Q8N815 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTD1Q8N815 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTD1Q8N815 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTD1Q8N815 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTD1Q8N815 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTD1Q8N815 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTD1Q8N815 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTD1Q8N815 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTD1Q8N815 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTD1Q8N815 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTD1Q8N815 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTD1Q8N815 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNTD1Q8N815 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNTD1Q8N815 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTD1Q8N815 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTD1Q8N815 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTD1Q8N815 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTD1Q8N815 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTD1Q8N815 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTD1Q8N815 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTD1Q8N815 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTD1Q8N815 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTD1Q8N815 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTD1Q8N815 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTD1Q8N815 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTD1Q8N815 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTD1Q8N815 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTD1Q8N815 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTD1Q8N815 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTD1Q8N815 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTD1Q8N815 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTD1Q8N815 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTD1Q8N815 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTD1Q8N815 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTD1Q8N815 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTD1Q8N815 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTD1Q8N815 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTD1Q8N815 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTD1Q8N815 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTD1Q8N815 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTD1Q8N815 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTD1Q8N815 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTD1Q8N815 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTD1Q8N815 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTD1Q8N815 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTD1Q8N815 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTD1Q8N815 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTD1Q8N815 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTD1Q8N815 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTD1Q8N815 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTD1Q8N815 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTD1Q8N815 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTD1Q8N815 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTD1Q8N815 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTD1Q8N815 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTD1Q8N815 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTD1Q8N815 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTD1Q8N815 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTD1Q8N815 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTD1Q8N815 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTD1Q8N815 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTD1Q8N815 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTD1Q8N815 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTD1Q8N815 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTD1Q8N815 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTD1Q8N815 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms