Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C3

TRIML2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML2, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIML2Q8N7C3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms