Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC155Q8N6L0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC155Q8N6L0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC155Q8N6L0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC155Q8N6L0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC155Q8N6L0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC155Q8N6L0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC155Q8N6L0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC155Q8N6L0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC155Q8N6L0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC155Q8N6L0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC155Q8N6L0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC155Q8N6L0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC155Q8N6L0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC155Q8N6L0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC155Q8N6L0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC155Q8N6L0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC155Q8N6L0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC155Q8N6L0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC155Q8N6L0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC155Q8N6L0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC155Q8N6L0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC155Q8N6L0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC155Q8N6L0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC155Q8N6L0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC155Q8N6L0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC155Q8N6L0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC155Q8N6L0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC155Q8N6L0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC155Q8N6L0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC155Q8N6L0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC155Q8N6L0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC155Q8N6L0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC155Q8N6L0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC155Q8N6L0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC155Q8N6L0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC155Q8N6L0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC155Q8N6L0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC155Q8N6L0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC155Q8N6L0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC155Q8N6L0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC155Q8N6L0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC155Q8N6L0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC155Q8N6L0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC155Q8N6L0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC155Q8N6L0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC155Q8N6L0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC155Q8N6L0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC155Q8N6L0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC155Q8N6L0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC155Q8N6L0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC155Q8N6L0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC155Q8N6L0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC155Q8N6L0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC155Q8N6L0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC155Q8N6L0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC155Q8N6L0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC155Q8N6L0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC155Q8N6L0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC155Q8N6L0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC155Q8N6L0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC155Q8N6L0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC155Q8N6L0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC155Q8N6L0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC155Q8N6L0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC155Q8N6L0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC155Q8N6L0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC155Q8N6L0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC155Q8N6L0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC155Q8N6L0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC155Q8N6L0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC155Q8N6L0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC155Q8N6L0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC155Q8N6L0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC155Q8N6L0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC155Q8N6L0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC155Q8N6L0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC155Q8N6L0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC155Q8N6L0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC155Q8N6L0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms