Protein–RNA interactions for Protein: Q8N159

NAGS, N-acetylglutamate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAGSQ8N159 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NAGSQ8N159 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NAGSQ8N159 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NAGSQ8N159 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NAGSQ8N159 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NAGSQ8N159 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NAGSQ8N159 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NAGSQ8N159 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NAGSQ8N159 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NAGSQ8N159 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NAGSQ8N159 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NAGSQ8N159 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAGSQ8N159 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAGSQ8N159 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAGSQ8N159 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAGSQ8N159 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAGSQ8N159 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAGSQ8N159 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAGSQ8N159 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NAGSQ8N159 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NAGSQ8N159 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NAGSQ8N159 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NAGSQ8N159 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NAGSQ8N159 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NAGSQ8N159 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NAGSQ8N159 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NAGSQ8N159 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NAGSQ8N159 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NAGSQ8N159 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NAGSQ8N159 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NAGSQ8N159 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAGSQ8N159 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAGSQ8N159 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAGSQ8N159 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NAGSQ8N159 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAGSQ8N159 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAGSQ8N159 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NAGSQ8N159 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NAGSQ8N159 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NAGSQ8N159 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NAGSQ8N159 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NAGSQ8N159 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NAGSQ8N159 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NAGSQ8N159 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NAGSQ8N159 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NAGSQ8N159 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NAGSQ8N159 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NAGSQ8N159 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAGSQ8N159 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAGSQ8N159 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAGSQ8N159 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAGSQ8N159 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAGSQ8N159 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAGSQ8N159 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAGSQ8N159 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAGSQ8N159 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAGSQ8N159 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAGSQ8N159 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAGSQ8N159 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NAGSQ8N159 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAGSQ8N159 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAGSQ8N159 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAGSQ8N159 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAGSQ8N159 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAGSQ8N159 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAGSQ8N159 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAGSQ8N159 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAGSQ8N159 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAGSQ8N159 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAGSQ8N159 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAGSQ8N159 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAGSQ8N159 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NAGSQ8N159 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAGSQ8N159 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAGSQ8N159 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAGSQ8N159 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAGSQ8N159 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NAGSQ8N159 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NAGSQ8N159 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NAGSQ8N159 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NAGSQ8N159 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAGSQ8N159 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAGSQ8N159 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAGSQ8N159 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAGSQ8N159 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAGSQ8N159 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAGSQ8N159 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAGSQ8N159 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAGSQ8N159 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAGSQ8N159 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAGSQ8N159 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAGSQ8N159 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NAGSQ8N159 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAGSQ8N159 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAGSQ8N159 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAGSQ8N159 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAGSQ8N159 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAGSQ8N159 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAGSQ8N159 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAGSQ8N159 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms