Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYM2

SLFN12, Schlafen family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12Q8IYM2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN12Q8IYM2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN12Q8IYM2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN12Q8IYM2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN12Q8IYM2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN12Q8IYM2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN12Q8IYM2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN12Q8IYM2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN12Q8IYM2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN12Q8IYM2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLFN12Q8IYM2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLFN12Q8IYM2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLFN12Q8IYM2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLFN12Q8IYM2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SLFN12Q8IYM2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLFN12Q8IYM2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLFN12Q8IYM2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLFN12Q8IYM2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLFN12Q8IYM2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLFN12Q8IYM2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLFN12Q8IYM2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLFN12Q8IYM2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLFN12Q8IYM2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLFN12Q8IYM2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLFN12Q8IYM2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLFN12Q8IYM2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLFN12Q8IYM2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLFN12Q8IYM2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLFN12Q8IYM2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLFN12Q8IYM2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLFN12Q8IYM2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLFN12Q8IYM2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SLFN12Q8IYM2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLFN12Q8IYM2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLFN12Q8IYM2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLFN12Q8IYM2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLFN12Q8IYM2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLFN12Q8IYM2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLFN12Q8IYM2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLFN12Q8IYM2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLFN12Q8IYM2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLFN12Q8IYM2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLFN12Q8IYM2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLFN12Q8IYM2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLFN12Q8IYM2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLFN12Q8IYM2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLFN12Q8IYM2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SLFN12Q8IYM2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLFN12Q8IYM2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLFN12Q8IYM2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLFN12Q8IYM2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLFN12Q8IYM2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLFN12Q8IYM2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLFN12Q8IYM2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLFN12Q8IYM2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLFN12Q8IYM2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SLFN12Q8IYM2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLFN12Q8IYM2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLFN12Q8IYM2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLFN12Q8IYM2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLFN12Q8IYM2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLFN12Q8IYM2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLFN12Q8IYM2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLFN12Q8IYM2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLFN12Q8IYM2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLFN12Q8IYM2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLFN12Q8IYM2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLFN12Q8IYM2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLFN12Q8IYM2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLFN12Q8IYM2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLFN12Q8IYM2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLFN12Q8IYM2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SLFN12Q8IYM2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLFN12Q8IYM2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLFN12Q8IYM2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLFN12Q8IYM2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLFN12Q8IYM2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLFN12Q8IYM2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLFN12Q8IYM2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLFN12Q8IYM2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLFN12Q8IYM2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLFN12Q8IYM2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLFN12Q8IYM2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLFN12Q8IYM2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLFN12Q8IYM2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLFN12Q8IYM2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLFN12Q8IYM2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLFN12Q8IYM2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLFN12Q8IYM2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLFN12Q8IYM2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLFN12Q8IYM2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLFN12Q8IYM2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLFN12Q8IYM2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SLFN12Q8IYM2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLFN12Q8IYM2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLFN12Q8IYM2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLFN12Q8IYM2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLFN12Q8IYM2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLFN12Q8IYM2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SLFN12Q8IYM2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms