Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYK2

CCDC105, Coiled-coil domain-containing protein 105, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC105Q8IYK2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC105Q8IYK2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC105Q8IYK2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC105Q8IYK2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC105Q8IYK2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC105Q8IYK2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC105Q8IYK2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC105Q8IYK2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC105Q8IYK2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC105Q8IYK2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC105Q8IYK2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC105Q8IYK2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC105Q8IYK2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC105Q8IYK2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC105Q8IYK2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC105Q8IYK2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC105Q8IYK2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC105Q8IYK2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC105Q8IYK2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC105Q8IYK2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC105Q8IYK2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC105Q8IYK2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC105Q8IYK2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC105Q8IYK2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC105Q8IYK2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC105Q8IYK2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC105Q8IYK2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC105Q8IYK2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC105Q8IYK2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC105Q8IYK2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC105Q8IYK2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC105Q8IYK2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC105Q8IYK2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC105Q8IYK2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC105Q8IYK2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC105Q8IYK2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC105Q8IYK2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC105Q8IYK2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC105Q8IYK2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC105Q8IYK2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC105Q8IYK2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC105Q8IYK2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms