Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVF7

FMNL3, Formin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMNL3Q8IVF7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FMNL3Q8IVF7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FMNL3Q8IVF7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FMNL3Q8IVF7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FMNL3Q8IVF7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FMNL3Q8IVF7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FMNL3Q8IVF7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FMNL3Q8IVF7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FMNL3Q8IVF7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
FMNL3Q8IVF7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FMNL3Q8IVF7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FMNL3Q8IVF7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FMNL3Q8IVF7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FMNL3Q8IVF7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FMNL3Q8IVF7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FMNL3Q8IVF7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FMNL3Q8IVF7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FMNL3Q8IVF7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FMNL3Q8IVF7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FMNL3Q8IVF7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FMNL3Q8IVF7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FMNL3Q8IVF7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FMNL3Q8IVF7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FMNL3Q8IVF7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FMNL3Q8IVF7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FMNL3Q8IVF7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FMNL3Q8IVF7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FMNL3Q8IVF7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FMNL3Q8IVF7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.6
FMNL3Q8IVF7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
FMNL3Q8IVF7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FMNL3Q8IVF7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FMNL3Q8IVF7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FMNL3Q8IVF7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FMNL3Q8IVF7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FMNL3Q8IVF7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FMNL3Q8IVF7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FMNL3Q8IVF7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FMNL3Q8IVF7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FMNL3Q8IVF7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FMNL3Q8IVF7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FMNL3Q8IVF7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FMNL3Q8IVF7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms