Protein–RNA interactions for Protein: Q86YP4

GATAD2A, Transcriptional repressor p66-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2AQ86YP4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GATAD2AQ86YP4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GATAD2AQ86YP4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GATAD2AQ86YP4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GATAD2AQ86YP4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GATAD2AQ86YP4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATAD2AQ86YP4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATAD2AQ86YP4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATAD2AQ86YP4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATAD2AQ86YP4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GATAD2AQ86YP4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATAD2AQ86YP4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATAD2AQ86YP4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATAD2AQ86YP4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATAD2AQ86YP4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GATAD2AQ86YP4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GATAD2AQ86YP4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GATAD2AQ86YP4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GATAD2AQ86YP4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GATAD2AQ86YP4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GATAD2AQ86YP4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GATAD2AQ86YP4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GATAD2AQ86YP4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GATAD2AQ86YP4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GATAD2AQ86YP4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GATAD2AQ86YP4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GATAD2AQ86YP4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GATAD2AQ86YP4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GATAD2AQ86YP4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GATAD2AQ86YP4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GATAD2AQ86YP4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GATAD2AQ86YP4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GATAD2AQ86YP4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GATAD2AQ86YP4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GATAD2AQ86YP4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GATAD2AQ86YP4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GATAD2AQ86YP4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GATAD2AQ86YP4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GATAD2AQ86YP4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GATAD2AQ86YP4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GATAD2AQ86YP4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GATAD2AQ86YP4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GATAD2AQ86YP4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GATAD2AQ86YP4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GATAD2AQ86YP4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms