Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNMB4Q86W47 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNMB4Q86W47 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNMB4Q86W47 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNMB4Q86W47 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNMB4Q86W47 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNMB4Q86W47 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNMB4Q86W47 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNMB4Q86W47 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNMB4Q86W47 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNMB4Q86W47 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNMB4Q86W47 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNMB4Q86W47 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNMB4Q86W47 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNMB4Q86W47 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNMB4Q86W47 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNMB4Q86W47 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNMB4Q86W47 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNMB4Q86W47 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNMB4Q86W47 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNMB4Q86W47 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNMB4Q86W47 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNMB4Q86W47 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNMB4Q86W47 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNMB4Q86W47 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNMB4Q86W47 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNMB4Q86W47 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNMB4Q86W47 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNMB4Q86W47 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNMB4Q86W47 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNMB4Q86W47 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNMB4Q86W47 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNMB4Q86W47 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNMB4Q86W47 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNMB4Q86W47 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNMB4Q86W47 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNMB4Q86W47 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNMB4Q86W47 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNMB4Q86W47 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNMB4Q86W47 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNMB4Q86W47 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNMB4Q86W47 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNMB4Q86W47 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNMB4Q86W47 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNMB4Q86W47 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNMB4Q86W47 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNMB4Q86W47 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNMB4Q86W47 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNMB4Q86W47 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNMB4Q86W47 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNMB4Q86W47 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNMB4Q86W47 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNMB4Q86W47 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNMB4Q86W47 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNMB4Q86W47 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNMB4Q86W47 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNMB4Q86W47 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNMB4Q86W47 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNMB4Q86W47 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNMB4Q86W47 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNMB4Q86W47 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNMB4Q86W47 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNMB4Q86W47 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNMB4Q86W47 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNMB4Q86W47 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNMB4Q86W47 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNMB4Q86W47 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNMB4Q86W47 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNMB4Q86W47 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNMB4Q86W47 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 262.2 ms