Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA6

RPAIN, RPA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAINQ86UA6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPAINQ86UA6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPAINQ86UA6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPAINQ86UA6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPAINQ86UA6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPAINQ86UA6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPAINQ86UA6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPAINQ86UA6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPAINQ86UA6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPAINQ86UA6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPAINQ86UA6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPAINQ86UA6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPAINQ86UA6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPAINQ86UA6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPAINQ86UA6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPAINQ86UA6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPAINQ86UA6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPAINQ86UA6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPAINQ86UA6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPAINQ86UA6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPAINQ86UA6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPAINQ86UA6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPAINQ86UA6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPAINQ86UA6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPAINQ86UA6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RPAINQ86UA6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPAINQ86UA6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPAINQ86UA6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPAINQ86UA6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPAINQ86UA6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPAINQ86UA6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPAINQ86UA6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPAINQ86UA6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPAINQ86UA6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RPAINQ86UA6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPAINQ86UA6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPAINQ86UA6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPAINQ86UA6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPAINQ86UA6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPAINQ86UA6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPAINQ86UA6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPAINQ86UA6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPAINQ86UA6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPAINQ86UA6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPAINQ86UA6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPAINQ86UA6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPAINQ86UA6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPAINQ86UA6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPAINQ86UA6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPAINQ86UA6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPAINQ86UA6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPAINQ86UA6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPAINQ86UA6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RPAINQ86UA6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPAINQ86UA6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPAINQ86UA6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPAINQ86UA6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPAINQ86UA6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPAINQ86UA6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPAINQ86UA6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPAINQ86UA6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPAINQ86UA6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RPAINQ86UA6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPAINQ86UA6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPAINQ86UA6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPAINQ86UA6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPAINQ86UA6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPAINQ86UA6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPAINQ86UA6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPAINQ86UA6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPAINQ86UA6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPAINQ86UA6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPAINQ86UA6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPAINQ86UA6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPAINQ86UA6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPAINQ86UA6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPAINQ86UA6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPAINQ86UA6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RPAINQ86UA6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPAINQ86UA6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPAINQ86UA6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPAINQ86UA6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPAINQ86UA6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPAINQ86UA6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPAINQ86UA6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPAINQ86UA6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPAINQ86UA6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPAINQ86UA6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPAINQ86UA6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPAINQ86UA6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPAINQ86UA6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPAINQ86UA6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPAINQ86UA6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPAINQ86UA6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPAINQ86UA6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPAINQ86UA6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPAINQ86UA6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPAINQ86UA6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPAINQ86UA6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPAINQ86UA6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms