Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
NPM2Q86SE8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NPM2Q86SE8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NPM2Q86SE8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NPM2Q86SE8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NPM2Q86SE8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NPM2Q86SE8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NPM2Q86SE8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NPM2Q86SE8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NPM2Q86SE8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NPM2Q86SE8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NPM2Q86SE8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NPM2Q86SE8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NPM2Q86SE8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NPM2Q86SE8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
NPM2Q86SE8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NPM2Q86SE8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NPM2Q86SE8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NPM2Q86SE8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NPM2Q86SE8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NPM2Q86SE8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NPM2Q86SE8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NPM2Q86SE8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NPM2Q86SE8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NPM2Q86SE8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NPM2Q86SE8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NPM2Q86SE8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NPM2Q86SE8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NPM2Q86SE8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NPM2Q86SE8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
NPM2Q86SE8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
NPM2Q86SE8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NPM2Q86SE8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NPM2Q86SE8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NPM2Q86SE8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NPM2Q86SE8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NPM2Q86SE8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NPM2Q86SE8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NPM2Q86SE8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NPM2Q86SE8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NPM2Q86SE8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NPM2Q86SE8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NPM2Q86SE8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NPM2Q86SE8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NPM2Q86SE8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NPM2Q86SE8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NPM2Q86SE8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NPM2Q86SE8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NPM2Q86SE8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NPM2Q86SE8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NPM2Q86SE8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NPM2Q86SE8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NPM2Q86SE8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NPM2Q86SE8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NPM2Q86SE8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
NPM2Q86SE8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NPM2Q86SE8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NPM2Q86SE8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NPM2Q86SE8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NPM2Q86SE8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NPM2Q86SE8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NPM2Q86SE8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NPM2Q86SE8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NPM2Q86SE8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NPM2Q86SE8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NPM2Q86SE8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NPM2Q86SE8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NPM2Q86SE8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NPM2Q86SE8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NPM2Q86SE8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NPM2Q86SE8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NPM2Q86SE8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NPM2Q86SE8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NPM2Q86SE8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
NPM2Q86SE8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NPM2Q86SE8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NPM2Q86SE8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NPM2Q86SE8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NPM2Q86SE8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NPM2Q86SE8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
NPM2Q86SE8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NPM2Q86SE8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NPM2Q86SE8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NPM2Q86SE8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NPM2Q86SE8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NPM2Q86SE8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NPM2Q86SE8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NPM2Q86SE8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NPM2Q86SE8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NPM2Q86SE8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NPM2Q86SE8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NPM2Q86SE8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NPM2Q86SE8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NPM2Q86SE8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NPM2Q86SE8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NPM2Q86SE8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NPM2Q86SE8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NPM2Q86SE8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NPM2Q86SE8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NPM2Q86SE8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms