Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5M5

TMC3, Transmembrane channel-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3Q7Z5M5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMC3Q7Z5M5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TMC3Q7Z5M5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMC3Q7Z5M5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMC3Q7Z5M5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMC3Q7Z5M5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMC3Q7Z5M5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMC3Q7Z5M5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMC3Q7Z5M5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMC3Q7Z5M5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMC3Q7Z5M5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMC3Q7Z5M5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMC3Q7Z5M5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMC3Q7Z5M5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC3Q7Z5M5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC3Q7Z5M5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC3Q7Z5M5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC3Q7Z5M5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC3Q7Z5M5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC3Q7Z5M5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC3Q7Z5M5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC3Q7Z5M5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC3Q7Z5M5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC3Q7Z5M5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMC3Q7Z5M5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMC3Q7Z5M5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMC3Q7Z5M5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMC3Q7Z5M5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMC3Q7Z5M5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMC3Q7Z5M5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMC3Q7Z5M5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TMC3Q7Z5M5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMC3Q7Z5M5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMC3Q7Z5M5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMC3Q7Z5M5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMC3Q7Z5M5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMC3Q7Z5M5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMC3Q7Z5M5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMC3Q7Z5M5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMC3Q7Z5M5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMC3Q7Z5M5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMC3Q7Z5M5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMC3Q7Z5M5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMC3Q7Z5M5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMC3Q7Z5M5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMC3Q7Z5M5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMC3Q7Z5M5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TMC3Q7Z5M5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TMC3Q7Z5M5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMC3Q7Z5M5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMC3Q7Z5M5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMC3Q7Z5M5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMC3Q7Z5M5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMC3Q7Z5M5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMC3Q7Z5M5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMC3Q7Z5M5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMC3Q7Z5M5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMC3Q7Z5M5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMC3Q7Z5M5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMC3Q7Z5M5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMC3Q7Z5M5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TMC3Q7Z5M5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMC3Q7Z5M5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMC3Q7Z5M5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMC3Q7Z5M5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMC3Q7Z5M5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMC3Q7Z5M5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMC3Q7Z5M5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMC3Q7Z5M5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMC3Q7Z5M5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMC3Q7Z5M5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMC3Q7Z5M5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMC3Q7Z5M5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMC3Q7Z5M5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMC3Q7Z5M5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMC3Q7Z5M5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMC3Q7Z5M5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMC3Q7Z5M5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TMC3Q7Z5M5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMC3Q7Z5M5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMC3Q7Z5M5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMC3Q7Z5M5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMC3Q7Z5M5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMC3Q7Z5M5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMC3Q7Z5M5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMC3Q7Z5M5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMC3Q7Z5M5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMC3Q7Z5M5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMC3Q7Z5M5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMC3Q7Z5M5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMC3Q7Z5M5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMC3Q7Z5M5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMC3Q7Z5M5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMC3Q7Z5M5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMC3Q7Z5M5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMC3Q7Z5M5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMC3Q7Z5M5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMC3Q7Z5M5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMC3Q7Z5M5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMC3Q7Z5M5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms