Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP9Q7RTR0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP9Q7RTR0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP9Q7RTR0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP9Q7RTR0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP9Q7RTR0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP9Q7RTR0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP9Q7RTR0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP9Q7RTR0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP9Q7RTR0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP9Q7RTR0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP9Q7RTR0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP9Q7RTR0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP9Q7RTR0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP9Q7RTR0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP9Q7RTR0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP9Q7RTR0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP9Q7RTR0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP9Q7RTR0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP9Q7RTR0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP9Q7RTR0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP9Q7RTR0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP9Q7RTR0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP9Q7RTR0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP9Q7RTR0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP9Q7RTR0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP9Q7RTR0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP9Q7RTR0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP9Q7RTR0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP9Q7RTR0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP9Q7RTR0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP9Q7RTR0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP9Q7RTR0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP9Q7RTR0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP9Q7RTR0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP9Q7RTR0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP9Q7RTR0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP9Q7RTR0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP9Q7RTR0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP9Q7RTR0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP9Q7RTR0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms