Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1W4

LRRC8D, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8D, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8DQ7L1W4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC8DQ7L1W4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC8DQ7L1W4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC8DQ7L1W4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC8DQ7L1W4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC8DQ7L1W4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC8DQ7L1W4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC8DQ7L1W4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC8DQ7L1W4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC8DQ7L1W4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC8DQ7L1W4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC8DQ7L1W4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC8DQ7L1W4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC8DQ7L1W4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC8DQ7L1W4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC8DQ7L1W4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC8DQ7L1W4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC8DQ7L1W4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC8DQ7L1W4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC8DQ7L1W4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC8DQ7L1W4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC8DQ7L1W4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC8DQ7L1W4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC8DQ7L1W4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC8DQ7L1W4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC8DQ7L1W4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC8DQ7L1W4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC8DQ7L1W4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC8DQ7L1W4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC8DQ7L1W4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC8DQ7L1W4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC8DQ7L1W4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC8DQ7L1W4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC8DQ7L1W4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC8DQ7L1W4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC8DQ7L1W4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC8DQ7L1W4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC8DQ7L1W4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC8DQ7L1W4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC8DQ7L1W4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC8DQ7L1W4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC8DQ7L1W4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC8DQ7L1W4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC8DQ7L1W4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC8DQ7L1W4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC8DQ7L1W4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC8DQ7L1W4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC8DQ7L1W4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC8DQ7L1W4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC8DQ7L1W4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC8DQ7L1W4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC8DQ7L1W4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC8DQ7L1W4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC8DQ7L1W4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC8DQ7L1W4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC8DQ7L1W4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC8DQ7L1W4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC8DQ7L1W4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC8DQ7L1W4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC8DQ7L1W4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC8DQ7L1W4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC8DQ7L1W4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC8DQ7L1W4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC8DQ7L1W4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC8DQ7L1W4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC8DQ7L1W4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC8DQ7L1W4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC8DQ7L1W4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC8DQ7L1W4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC8DQ7L1W4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC8DQ7L1W4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC8DQ7L1W4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC8DQ7L1W4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC8DQ7L1W4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC8DQ7L1W4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC8DQ7L1W4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRC8DQ7L1W4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRC8DQ7L1W4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC8DQ7L1W4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC8DQ7L1W4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC8DQ7L1W4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC8DQ7L1W4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC8DQ7L1W4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC8DQ7L1W4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC8DQ7L1W4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC8DQ7L1W4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC8DQ7L1W4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC8DQ7L1W4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC8DQ7L1W4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC8DQ7L1W4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC8DQ7L1W4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC8DQ7L1W4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC8DQ7L1W4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC8DQ7L1W4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC8DQ7L1W4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC8DQ7L1W4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC8DQ7L1W4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC8DQ7L1W4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC8DQ7L1W4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC8DQ7L1W4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms