Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RUFY3Q7L099 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RUFY3Q7L099 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RUFY3Q7L099 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RUFY3Q7L099 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RUFY3Q7L099 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RUFY3Q7L099 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RUFY3Q7L099 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RUFY3Q7L099 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RUFY3Q7L099 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RUFY3Q7L099 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RUFY3Q7L099 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RUFY3Q7L099 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RUFY3Q7L099 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RUFY3Q7L099 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RUFY3Q7L099 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
RUFY3Q7L099 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RUFY3Q7L099 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RUFY3Q7L099 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RUFY3Q7L099 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RUFY3Q7L099 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RUFY3Q7L099 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RUFY3Q7L099 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RUFY3Q7L099 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RUFY3Q7L099 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RUFY3Q7L099 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RUFY3Q7L099 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RUFY3Q7L099 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RUFY3Q7L099 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RUFY3Q7L099 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RUFY3Q7L099 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RUFY3Q7L099 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RUFY3Q7L099 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RUFY3Q7L099 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RUFY3Q7L099 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RUFY3Q7L099 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RUFY3Q7L099 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RUFY3Q7L099 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RUFY3Q7L099 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RUFY3Q7L099 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RUFY3Q7L099 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RUFY3Q7L099 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RUFY3Q7L099 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RUFY3Q7L099 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RUFY3Q7L099 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RUFY3Q7L099 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms