Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFX8Q6ZV50 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFX8Q6ZV50 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFX8Q6ZV50 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFX8Q6ZV50 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFX8Q6ZV50 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFX8Q6ZV50 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFX8Q6ZV50 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFX8Q6ZV50 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFX8Q6ZV50 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFX8Q6ZV50 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RFX8Q6ZV50 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFX8Q6ZV50 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFX8Q6ZV50 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RFX8Q6ZV50 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFX8Q6ZV50 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFX8Q6ZV50 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFX8Q6ZV50 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RFX8Q6ZV50 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RFX8Q6ZV50 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RFX8Q6ZV50 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RFX8Q6ZV50 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFX8Q6ZV50 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFX8Q6ZV50 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFX8Q6ZV50 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RFX8Q6ZV50 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFX8Q6ZV50 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFX8Q6ZV50 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFX8Q6ZV50 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFX8Q6ZV50 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFX8Q6ZV50 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFX8Q6ZV50 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFX8Q6ZV50 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RFX8Q6ZV50 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFX8Q6ZV50 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFX8Q6ZV50 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFX8Q6ZV50 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFX8Q6ZV50 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFX8Q6ZV50 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFX8Q6ZV50 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RFX8Q6ZV50 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFX8Q6ZV50 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFX8Q6ZV50 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFX8Q6ZV50 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFX8Q6ZV50 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFX8Q6ZV50 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFX8Q6ZV50 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFX8Q6ZV50 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFX8Q6ZV50 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RFX8Q6ZV50 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFX8Q6ZV50 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RFX8Q6ZV50 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFX8Q6ZV50 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFX8Q6ZV50 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFX8Q6ZV50 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFX8Q6ZV50 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFX8Q6ZV50 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFX8Q6ZV50 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFX8Q6ZV50 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFX8Q6ZV50 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RFX8Q6ZV50 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFX8Q6ZV50 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFX8Q6ZV50 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFX8Q6ZV50 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFX8Q6ZV50 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFX8Q6ZV50 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFX8Q6ZV50 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFX8Q6ZV50 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFX8Q6ZV50 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFX8Q6ZV50 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFX8Q6ZV50 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RFX8Q6ZV50 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFX8Q6ZV50 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFX8Q6ZV50 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFX8Q6ZV50 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFX8Q6ZV50 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFX8Q6ZV50 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFX8Q6ZV50 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RFX8Q6ZV50 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFX8Q6ZV50 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RFX8Q6ZV50 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RFX8Q6ZV50 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFX8Q6ZV50 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFX8Q6ZV50 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFX8Q6ZV50 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFX8Q6ZV50 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFX8Q6ZV50 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFX8Q6ZV50 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFX8Q6ZV50 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RFX8Q6ZV50 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFX8Q6ZV50 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFX8Q6ZV50 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFX8Q6ZV50 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFX8Q6ZV50 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFX8Q6ZV50 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFX8Q6ZV50 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFX8Q6ZV50 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFX8Q6ZV50 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFX8Q6ZV50 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFX8Q6ZV50 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms