Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms