Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDZRN4Q6ZMN7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDZRN4Q6ZMN7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDZRN4Q6ZMN7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDZRN4Q6ZMN7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDZRN4Q6ZMN7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDZRN4Q6ZMN7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDZRN4Q6ZMN7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDZRN4Q6ZMN7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDZRN4Q6ZMN7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDZRN4Q6ZMN7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDZRN4Q6ZMN7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms