Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C16orf54Q6UWD8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms