Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMARCD3Q6STE5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117 ms