Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHR2

ULK3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK3Q6PHR2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ULK3Q6PHR2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ULK3Q6PHR2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ULK3Q6PHR2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ULK3Q6PHR2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ULK3Q6PHR2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ULK3Q6PHR2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ULK3Q6PHR2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ULK3Q6PHR2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ULK3Q6PHR2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ULK3Q6PHR2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ULK3Q6PHR2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ULK3Q6PHR2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ULK3Q6PHR2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ULK3Q6PHR2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ULK3Q6PHR2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ULK3Q6PHR2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ULK3Q6PHR2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ULK3Q6PHR2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ULK3Q6PHR2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ULK3Q6PHR2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ULK3Q6PHR2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ULK3Q6PHR2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ULK3Q6PHR2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ULK3Q6PHR2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ULK3Q6PHR2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ULK3Q6PHR2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ULK3Q6PHR2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ULK3Q6PHR2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ULK3Q6PHR2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ULK3Q6PHR2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ULK3Q6PHR2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ULK3Q6PHR2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ULK3Q6PHR2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ULK3Q6PHR2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ULK3Q6PHR2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ULK3Q6PHR2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ULK3Q6PHR2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ULK3Q6PHR2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ULK3Q6PHR2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ULK3Q6PHR2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ULK3Q6PHR2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ULK3Q6PHR2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ULK3Q6PHR2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms