Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL35Q6PF15 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KLHL35Q6PF15 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms