Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PRPF40BQ6NWY9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRPF40BQ6NWY9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRPF40BQ6NWY9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRPF40BQ6NWY9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRPF40BQ6NWY9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRPF40BQ6NWY9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRPF40BQ6NWY9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRPF40BQ6NWY9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRPF40BQ6NWY9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRPF40BQ6NWY9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRPF40BQ6NWY9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRPF40BQ6NWY9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PRPF40BQ6NWY9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRPF40BQ6NWY9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRPF40BQ6NWY9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRPF40BQ6NWY9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRPF40BQ6NWY9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRPF40BQ6NWY9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRPF40BQ6NWY9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRPF40BQ6NWY9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRPF40BQ6NWY9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRPF40BQ6NWY9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PRPF40BQ6NWY9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRPF40BQ6NWY9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRPF40BQ6NWY9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRPF40BQ6NWY9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRPF40BQ6NWY9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRPF40BQ6NWY9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRPF40BQ6NWY9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRPF40BQ6NWY9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRPF40BQ6NWY9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRPF40BQ6NWY9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
PRPF40BQ6NWY9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PRPF40BQ6NWY9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRPF40BQ6NWY9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRPF40BQ6NWY9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRPF40BQ6NWY9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRPF40BQ6NWY9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRPF40BQ6NWY9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRPF40BQ6NWY9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRPF40BQ6NWY9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRPF40BQ6NWY9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRPF40BQ6NWY9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRPF40BQ6NWY9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRPF40BQ6NWY9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRPF40BQ6NWY9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRPF40BQ6NWY9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRPF40BQ6NWY9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PRPF40BQ6NWY9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRPF40BQ6NWY9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRPF40BQ6NWY9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRPF40BQ6NWY9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRPF40BQ6NWY9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRPF40BQ6NWY9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRPF40BQ6NWY9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRPF40BQ6NWY9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRPF40BQ6NWY9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRPF40BQ6NWY9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRPF40BQ6NWY9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRPF40BQ6NWY9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRPF40BQ6NWY9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRPF40BQ6NWY9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRPF40BQ6NWY9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRPF40BQ6NWY9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PRPF40BQ6NWY9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PRPF40BQ6NWY9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PRPF40BQ6NWY9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRPF40BQ6NWY9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRPF40BQ6NWY9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRPF40BQ6NWY9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PRPF40BQ6NWY9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PRPF40BQ6NWY9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRPF40BQ6NWY9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PRPF40BQ6NWY9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRPF40BQ6NWY9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRPF40BQ6NWY9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PRPF40BQ6NWY9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRPF40BQ6NWY9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRPF40BQ6NWY9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRPF40BQ6NWY9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRPF40BQ6NWY9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PRPF40BQ6NWY9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRPF40BQ6NWY9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRPF40BQ6NWY9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRPF40BQ6NWY9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRPF40BQ6NWY9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRPF40BQ6NWY9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRPF40BQ6NWY9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PRPF40BQ6NWY9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRPF40BQ6NWY9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRPF40BQ6NWY9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRPF40BQ6NWY9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRPF40BQ6NWY9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRPF40BQ6NWY9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRPF40BQ6NWY9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRPF40BQ6NWY9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRPF40BQ6NWY9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRPF40BQ6NWY9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PRPF40BQ6NWY9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms