Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT80Q6KB66 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms