Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE5

LCN12, Epididymal-specific lipocalin-12, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN12Q6JVE5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms