Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRAMD4Q6IC98 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRAMD4Q6IC98 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRAMD4Q6IC98 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRAMD4Q6IC98 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRAMD4Q6IC98 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRAMD4Q6IC98 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRAMD4Q6IC98 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRAMD4Q6IC98 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRAMD4Q6IC98 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRAMD4Q6IC98 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRAMD4Q6IC98 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRAMD4Q6IC98 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRAMD4Q6IC98 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRAMD4Q6IC98 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRAMD4Q6IC98 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRAMD4Q6IC98 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRAMD4Q6IC98 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GRAMD4Q6IC98 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRAMD4Q6IC98 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRAMD4Q6IC98 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRAMD4Q6IC98 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRAMD4Q6IC98 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRAMD4Q6IC98 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRAMD4Q6IC98 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRAMD4Q6IC98 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRAMD4Q6IC98 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRAMD4Q6IC98 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRAMD4Q6IC98 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GRAMD4Q6IC98 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GRAMD4Q6IC98 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRAMD4Q6IC98 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRAMD4Q6IC98 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRAMD4Q6IC98 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRAMD4Q6IC98 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRAMD4Q6IC98 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRAMD4Q6IC98 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRAMD4Q6IC98 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRAMD4Q6IC98 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRAMD4Q6IC98 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRAMD4Q6IC98 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRAMD4Q6IC98 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRAMD4Q6IC98 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRAMD4Q6IC98 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GRAMD4Q6IC98 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRAMD4Q6IC98 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms