Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CARMIL1Q5VZK9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CARMIL1Q5VZK9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CARMIL1Q5VZK9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CARMIL1Q5VZK9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CARMIL1Q5VZK9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CARMIL1Q5VZK9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CARMIL1Q5VZK9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CARMIL1Q5VZK9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CARMIL1Q5VZK9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CARMIL1Q5VZK9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CARMIL1Q5VZK9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CARMIL1Q5VZK9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CARMIL1Q5VZK9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CARMIL1Q5VZK9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
CARMIL1Q5VZK9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
CARMIL1Q5VZK9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
CARMIL1Q5VZK9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
CARMIL1Q5VZK9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
CARMIL1Q5VZK9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
CARMIL1Q5VZK9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
CARMIL1Q5VZK9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
CARMIL1Q5VZK9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
CARMIL1Q5VZK9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
CARMIL1Q5VZK9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
CARMIL1Q5VZK9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CARMIL1Q5VZK9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CARMIL1Q5VZK9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
CARMIL1Q5VZK9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
CARMIL1Q5VZK9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
CARMIL1Q5VZK9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC38.22■■■■□ 3.71
CARMIL1Q5VZK9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
CARMIL1Q5VZK9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC38.21■■■■□ 3.71
CARMIL1Q5VZK9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CARMIL1Q5VZK9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.2■■■■□ 3.71
CARMIL1Q5VZK9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
CARMIL1Q5VZK9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
CARMIL1Q5VZK9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC38.2■■■■□ 3.71
CARMIL1Q5VZK9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CARMIL1Q5VZK9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CARMIL1Q5VZK9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CARMIL1Q5VZK9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
CARMIL1Q5VZK9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
CARMIL1Q5VZK9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
CARMIL1Q5VZK9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CARMIL1Q5VZK9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
CARMIL1Q5VZK9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
CARMIL1Q5VZK9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
CARMIL1Q5VZK9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
CARMIL1Q5VZK9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
CARMIL1Q5VZK9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CARMIL1Q5VZK9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
CARMIL1Q5VZK9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CARMIL1Q5VZK9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
CARMIL1Q5VZK9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
CARMIL1Q5VZK9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
CARMIL1Q5VZK9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
CARMIL1Q5VZK9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
CARMIL1Q5VZK9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
CARMIL1Q5VZK9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC38.15■■■■□ 3.7
CARMIL1Q5VZK9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CARMIL1Q5VZK9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CARMIL1Q5VZK9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CARMIL1Q5VZK9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
CARMIL1Q5VZK9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CARMIL1Q5VZK9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CARMIL1Q5VZK9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
CARMIL1Q5VZK9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
CARMIL1Q5VZK9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
CARMIL1Q5VZK9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
CARMIL1Q5VZK9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
CARMIL1Q5VZK9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
CARMIL1Q5VZK9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
CARMIL1Q5VZK9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
CARMIL1Q5VZK9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
CARMIL1Q5VZK9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
CARMIL1Q5VZK9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
CARMIL1Q5VZK9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CARMIL1Q5VZK9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CARMIL1Q5VZK9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CARMIL1Q5VZK9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CARMIL1Q5VZK9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CARMIL1Q5VZK9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
CARMIL1Q5VZK9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CARMIL1Q5VZK9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
CARMIL1Q5VZK9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
CARMIL1Q5VZK9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
CARMIL1Q5VZK9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
CARMIL1Q5VZK9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
CARMIL1Q5VZK9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
CARMIL1Q5VZK9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
CARMIL1Q5VZK9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
CARMIL1Q5VZK9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
CARMIL1Q5VZK9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
CARMIL1Q5VZK9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
CARMIL1Q5VZK9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
CARMIL1Q5VZK9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
CARMIL1Q5VZK9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
CARMIL1Q5VZK9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
CARMIL1Q5VZK9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms