Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLX4IPQ5VYV7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms