Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SAMD13Q5VXD3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SAMD13Q5VXD3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SAMD13Q5VXD3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SAMD13Q5VXD3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SAMD13Q5VXD3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SAMD13Q5VXD3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SAMD13Q5VXD3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD13Q5VXD3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD13Q5VXD3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD13Q5VXD3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD13Q5VXD3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD13Q5VXD3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD13Q5VXD3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD13Q5VXD3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD13Q5VXD3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD13Q5VXD3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD13Q5VXD3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD13Q5VXD3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD13Q5VXD3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SAMD13Q5VXD3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SAMD13Q5VXD3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SAMD13Q5VXD3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SAMD13Q5VXD3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD13Q5VXD3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms