Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
RPRD2Q5VT52 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
RPRD2Q5VT52 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
RPRD2Q5VT52 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
RPRD2Q5VT52 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
RPRD2Q5VT52 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
RPRD2Q5VT52 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
RPRD2Q5VT52 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
RPRD2Q5VT52 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
RPRD2Q5VT52 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
RPRD2Q5VT52 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
RPRD2Q5VT52 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
RPRD2Q5VT52 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
RPRD2Q5VT52 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
RPRD2Q5VT52 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
RPRD2Q5VT52 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
RPRD2Q5VT52 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
RPRD2Q5VT52 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
RPRD2Q5VT52 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
RPRD2Q5VT52 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
RPRD2Q5VT52 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
RPRD2Q5VT52 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RPRD2Q5VT52 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
RPRD2Q5VT52 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
RPRD2Q5VT52 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RPRD2Q5VT52 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
RPRD2Q5VT52 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RPRD2Q5VT52 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
RPRD2Q5VT52 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
RPRD2Q5VT52 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
RPRD2Q5VT52 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
RPRD2Q5VT52 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
RPRD2Q5VT52 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
RPRD2Q5VT52 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
RPRD2Q5VT52 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
RPRD2Q5VT52 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
RPRD2Q5VT52 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
RPRD2Q5VT52 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
RPRD2Q5VT52 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
RPRD2Q5VT52 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
RPRD2Q5VT52 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
RPRD2Q5VT52 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
RPRD2Q5VT52 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
RPRD2Q5VT52 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
RPRD2Q5VT52 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
RPRD2Q5VT52 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
RPRD2Q5VT52 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
RPRD2Q5VT52 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
RPRD2Q5VT52 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
RPRD2Q5VT52 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
RPRD2Q5VT52 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
RPRD2Q5VT52 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
RPRD2Q5VT52 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
RPRD2Q5VT52 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
RPRD2Q5VT52 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
RPRD2Q5VT52 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
RPRD2Q5VT52 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
RPRD2Q5VT52 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
RPRD2Q5VT52 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
RPRD2Q5VT52 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
RPRD2Q5VT52 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
RPRD2Q5VT52 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
RPRD2Q5VT52 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RPRD2Q5VT52 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RPRD2Q5VT52 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RPRD2Q5VT52 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RPRD2Q5VT52 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RPRD2Q5VT52 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RPRD2Q5VT52 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RPRD2Q5VT52 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RPRD2Q5VT52 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RPRD2Q5VT52 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
RPRD2Q5VT52 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
RPRD2Q5VT52 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
RPRD2Q5VT52 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
RPRD2Q5VT52 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
RPRD2Q5VT52 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
RPRD2Q5VT52 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
RPRD2Q5VT52 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
RPRD2Q5VT52 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
RPRD2Q5VT52 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
RPRD2Q5VT52 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
RPRD2Q5VT52 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
RPRD2Q5VT52 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
RPRD2Q5VT52 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
RPRD2Q5VT52 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
RPRD2Q5VT52 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
RPRD2Q5VT52 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
RPRD2Q5VT52 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
RPRD2Q5VT52 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
RPRD2Q5VT52 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RPRD2Q5VT52 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RPRD2Q5VT52 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
RPRD2Q5VT52 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
RPRD2Q5VT52 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
RPRD2Q5VT52 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
RPRD2Q5VT52 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
RPRD2Q5VT52 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
RPRD2Q5VT52 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
RPRD2Q5VT52 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms