Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM164Q5U3C3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TMEM164Q5U3C3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms