Protein–RNA interactions for Protein: Q5T655

CFAP58, Cilia- and flagella-associated protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP58Q5T655 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP58Q5T655 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP58Q5T655 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP58Q5T655 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP58Q5T655 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP58Q5T655 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP58Q5T655 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP58Q5T655 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP58Q5T655 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP58Q5T655 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP58Q5T655 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP58Q5T655 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP58Q5T655 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP58Q5T655 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP58Q5T655 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP58Q5T655 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP58Q5T655 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP58Q5T655 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP58Q5T655 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP58Q5T655 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP58Q5T655 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP58Q5T655 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP58Q5T655 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP58Q5T655 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP58Q5T655 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP58Q5T655 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP58Q5T655 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP58Q5T655 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP58Q5T655 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP58Q5T655 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP58Q5T655 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP58Q5T655 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP58Q5T655 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP58Q5T655 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP58Q5T655 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP58Q5T655 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms