Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2D2

TREML2, Trem-like transcript 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML2Q5T2D2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TREML2Q5T2D2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TREML2Q5T2D2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TREML2Q5T2D2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TREML2Q5T2D2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TREML2Q5T2D2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TREML2Q5T2D2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TREML2Q5T2D2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TREML2Q5T2D2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TREML2Q5T2D2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TREML2Q5T2D2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TREML2Q5T2D2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TREML2Q5T2D2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TREML2Q5T2D2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TREML2Q5T2D2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TREML2Q5T2D2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TREML2Q5T2D2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TREML2Q5T2D2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TREML2Q5T2D2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TREML2Q5T2D2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TREML2Q5T2D2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TREML2Q5T2D2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TREML2Q5T2D2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TREML2Q5T2D2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TREML2Q5T2D2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TREML2Q5T2D2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TREML2Q5T2D2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TREML2Q5T2D2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TREML2Q5T2D2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TREML2Q5T2D2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TREML2Q5T2D2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TREML2Q5T2D2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TREML2Q5T2D2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TREML2Q5T2D2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TREML2Q5T2D2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TREML2Q5T2D2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TREML2Q5T2D2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TREML2Q5T2D2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TREML2Q5T2D2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TREML2Q5T2D2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TREML2Q5T2D2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TREML2Q5T2D2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TREML2Q5T2D2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TREML2Q5T2D2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TREML2Q5T2D2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TREML2Q5T2D2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TREML2Q5T2D2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TREML2Q5T2D2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TREML2Q5T2D2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TREML2Q5T2D2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TREML2Q5T2D2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TREML2Q5T2D2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TREML2Q5T2D2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TREML2Q5T2D2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TREML2Q5T2D2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TREML2Q5T2D2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TREML2Q5T2D2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TREML2Q5T2D2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TREML2Q5T2D2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TREML2Q5T2D2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TREML2Q5T2D2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TREML2Q5T2D2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TREML2Q5T2D2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TREML2Q5T2D2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TREML2Q5T2D2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TREML2Q5T2D2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TREML2Q5T2D2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TREML2Q5T2D2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TREML2Q5T2D2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TREML2Q5T2D2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TREML2Q5T2D2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TREML2Q5T2D2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TREML2Q5T2D2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TREML2Q5T2D2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TREML2Q5T2D2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TREML2Q5T2D2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TREML2Q5T2D2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TREML2Q5T2D2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TREML2Q5T2D2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TREML2Q5T2D2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TREML2Q5T2D2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TREML2Q5T2D2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TREML2Q5T2D2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TREML2Q5T2D2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TREML2Q5T2D2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TREML2Q5T2D2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TREML2Q5T2D2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TREML2Q5T2D2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TREML2Q5T2D2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TREML2Q5T2D2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TREML2Q5T2D2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TREML2Q5T2D2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TREML2Q5T2D2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TREML2Q5T2D2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TREML2Q5T2D2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TREML2Q5T2D2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TREML2Q5T2D2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TREML2Q5T2D2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TREML2Q5T2D2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TREML2Q5T2D2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.1 ms