Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CELF3Q5SZQ8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CELF3Q5SZQ8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CELF3Q5SZQ8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CELF3Q5SZQ8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CELF3Q5SZQ8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CELF3Q5SZQ8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CELF3Q5SZQ8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CELF3Q5SZQ8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CELF3Q5SZQ8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CELF3Q5SZQ8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CELF3Q5SZQ8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CELF3Q5SZQ8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CELF3Q5SZQ8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CELF3Q5SZQ8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CELF3Q5SZQ8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CELF3Q5SZQ8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CELF3Q5SZQ8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CELF3Q5SZQ8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CELF3Q5SZQ8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CELF3Q5SZQ8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CELF3Q5SZQ8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CELF3Q5SZQ8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CELF3Q5SZQ8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CELF3Q5SZQ8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CELF3Q5SZQ8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CELF3Q5SZQ8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CELF3Q5SZQ8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CELF3Q5SZQ8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CELF3Q5SZQ8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CELF3Q5SZQ8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CELF3Q5SZQ8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CELF3Q5SZQ8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CELF3Q5SZQ8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CELF3Q5SZQ8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CELF3Q5SZQ8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CELF3Q5SZQ8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CELF3Q5SZQ8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CELF3Q5SZQ8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CELF3Q5SZQ8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CELF3Q5SZQ8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CELF3Q5SZQ8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CELF3Q5SZQ8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CELF3Q5SZQ8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CELF3Q5SZQ8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CELF3Q5SZQ8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CELF3Q5SZQ8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CELF3Q5SZQ8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CELF3Q5SZQ8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CELF3Q5SZQ8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CELF3Q5SZQ8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CELF3Q5SZQ8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CELF3Q5SZQ8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CELF3Q5SZQ8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CELF3Q5SZQ8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CELF3Q5SZQ8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CELF3Q5SZQ8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CELF3Q5SZQ8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CELF3Q5SZQ8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CELF3Q5SZQ8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CELF3Q5SZQ8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CELF3Q5SZQ8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CELF3Q5SZQ8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CELF3Q5SZQ8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CELF3Q5SZQ8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CELF3Q5SZQ8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CELF3Q5SZQ8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CELF3Q5SZQ8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CELF3Q5SZQ8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CELF3Q5SZQ8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CELF3Q5SZQ8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CELF3Q5SZQ8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CELF3Q5SZQ8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CELF3Q5SZQ8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CELF3Q5SZQ8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CELF3Q5SZQ8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CELF3Q5SZQ8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CELF3Q5SZQ8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CELF3Q5SZQ8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CELF3Q5SZQ8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CELF3Q5SZQ8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CELF3Q5SZQ8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CELF3Q5SZQ8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CELF3Q5SZQ8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CELF3Q5SZQ8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CELF3Q5SZQ8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CELF3Q5SZQ8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CELF3Q5SZQ8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CELF3Q5SZQ8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CELF3Q5SZQ8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CELF3Q5SZQ8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CELF3Q5SZQ8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CELF3Q5SZQ8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CELF3Q5SZQ8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CELF3Q5SZQ8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CELF3Q5SZQ8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CELF3Q5SZQ8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CELF3Q5SZQ8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CELF3Q5SZQ8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CELF3Q5SZQ8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
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