Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C10orf55Q5SWW7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C10orf55Q5SWW7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C10orf55Q5SWW7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C10orf55Q5SWW7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C10orf55Q5SWW7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C10orf55Q5SWW7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C10orf55Q5SWW7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C10orf55Q5SWW7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C10orf55Q5SWW7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms