Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LDLRAP1Q5SW96 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LDLRAP1Q5SW96 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LDLRAP1Q5SW96 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LDLRAP1Q5SW96 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LDLRAP1Q5SW96 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LDLRAP1Q5SW96 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LDLRAP1Q5SW96 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LDLRAP1Q5SW96 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LDLRAP1Q5SW96 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LDLRAP1Q5SW96 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LDLRAP1Q5SW96 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LDLRAP1Q5SW96 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LDLRAP1Q5SW96 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LDLRAP1Q5SW96 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LDLRAP1Q5SW96 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LDLRAP1Q5SW96 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LDLRAP1Q5SW96 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LDLRAP1Q5SW96 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LDLRAP1Q5SW96 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LDLRAP1Q5SW96 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LDLRAP1Q5SW96 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LDLRAP1Q5SW96 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LDLRAP1Q5SW96 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LDLRAP1Q5SW96 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LDLRAP1Q5SW96 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LDLRAP1Q5SW96 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LDLRAP1Q5SW96 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LDLRAP1Q5SW96 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LDLRAP1Q5SW96 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LDLRAP1Q5SW96 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LDLRAP1Q5SW96 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LDLRAP1Q5SW96 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LDLRAP1Q5SW96 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LDLRAP1Q5SW96 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LDLRAP1Q5SW96 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LDLRAP1Q5SW96 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LDLRAP1Q5SW96 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LDLRAP1Q5SW96 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LDLRAP1Q5SW96 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LDLRAP1Q5SW96 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LDLRAP1Q5SW96 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LDLRAP1Q5SW96 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LDLRAP1Q5SW96 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LDLRAP1Q5SW96 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LDLRAP1Q5SW96 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LDLRAP1Q5SW96 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LDLRAP1Q5SW96 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LDLRAP1Q5SW96 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms