Protein–RNA interactions for Protein: Q5JXA9

SIRPB2, Signal-regulatory protein beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRPB2Q5JXA9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIRPB2Q5JXA9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIRPB2Q5JXA9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIRPB2Q5JXA9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIRPB2Q5JXA9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIRPB2Q5JXA9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIRPB2Q5JXA9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIRPB2Q5JXA9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIRPB2Q5JXA9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIRPB2Q5JXA9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIRPB2Q5JXA9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIRPB2Q5JXA9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIRPB2Q5JXA9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIRPB2Q5JXA9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIRPB2Q5JXA9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIRPB2Q5JXA9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SIRPB2Q5JXA9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIRPB2Q5JXA9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIRPB2Q5JXA9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIRPB2Q5JXA9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SIRPB2Q5JXA9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIRPB2Q5JXA9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIRPB2Q5JXA9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIRPB2Q5JXA9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIRPB2Q5JXA9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SIRPB2Q5JXA9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIRPB2Q5JXA9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIRPB2Q5JXA9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIRPB2Q5JXA9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIRPB2Q5JXA9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIRPB2Q5JXA9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIRPB2Q5JXA9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIRPB2Q5JXA9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SIRPB2Q5JXA9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SIRPB2Q5JXA9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIRPB2Q5JXA9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIRPB2Q5JXA9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIRPB2Q5JXA9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIRPB2Q5JXA9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIRPB2Q5JXA9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIRPB2Q5JXA9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIRPB2Q5JXA9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIRPB2Q5JXA9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SIRPB2Q5JXA9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIRPB2Q5JXA9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIRPB2Q5JXA9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIRPB2Q5JXA9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIRPB2Q5JXA9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIRPB2Q5JXA9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIRPB2Q5JXA9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIRPB2Q5JXA9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIRPB2Q5JXA9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIRPB2Q5JXA9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIRPB2Q5JXA9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIRPB2Q5JXA9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIRPB2Q5JXA9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIRPB2Q5JXA9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIRPB2Q5JXA9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIRPB2Q5JXA9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIRPB2Q5JXA9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIRPB2Q5JXA9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIRPB2Q5JXA9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIRPB2Q5JXA9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIRPB2Q5JXA9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIRPB2Q5JXA9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SIRPB2Q5JXA9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIRPB2Q5JXA9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIRPB2Q5JXA9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIRPB2Q5JXA9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIRPB2Q5JXA9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIRPB2Q5JXA9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIRPB2Q5JXA9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIRPB2Q5JXA9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIRPB2Q5JXA9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIRPB2Q5JXA9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIRPB2Q5JXA9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIRPB2Q5JXA9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIRPB2Q5JXA9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIRPB2Q5JXA9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIRPB2Q5JXA9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIRPB2Q5JXA9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIRPB2Q5JXA9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIRPB2Q5JXA9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIRPB2Q5JXA9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SIRPB2Q5JXA9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SIRPB2Q5JXA9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIRPB2Q5JXA9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIRPB2Q5JXA9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIRPB2Q5JXA9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIRPB2Q5JXA9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIRPB2Q5JXA9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIRPB2Q5JXA9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIRPB2Q5JXA9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIRPB2Q5JXA9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIRPB2Q5JXA9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIRPB2Q5JXA9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIRPB2Q5JXA9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIRPB2Q5JXA9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIRPB2Q5JXA9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIRPB2Q5JXA9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms