Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRA6

MIA3, Transport and Golgi organization protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIA3Q5JRA6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MIA3Q5JRA6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MIA3Q5JRA6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MIA3Q5JRA6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MIA3Q5JRA6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MIA3Q5JRA6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MIA3Q5JRA6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MIA3Q5JRA6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MIA3Q5JRA6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MIA3Q5JRA6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MIA3Q5JRA6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MIA3Q5JRA6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MIA3Q5JRA6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MIA3Q5JRA6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MIA3Q5JRA6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MIA3Q5JRA6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MIA3Q5JRA6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MIA3Q5JRA6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MIA3Q5JRA6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MIA3Q5JRA6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MIA3Q5JRA6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MIA3Q5JRA6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MIA3Q5JRA6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MIA3Q5JRA6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MIA3Q5JRA6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MIA3Q5JRA6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MIA3Q5JRA6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MIA3Q5JRA6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MIA3Q5JRA6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MIA3Q5JRA6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MIA3Q5JRA6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MIA3Q5JRA6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MIA3Q5JRA6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MIA3Q5JRA6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MIA3Q5JRA6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MIA3Q5JRA6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MIA3Q5JRA6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MIA3Q5JRA6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MIA3Q5JRA6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MIA3Q5JRA6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MIA3Q5JRA6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MIA3Q5JRA6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MIA3Q5JRA6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MIA3Q5JRA6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MIA3Q5JRA6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MIA3Q5JRA6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MIA3Q5JRA6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MIA3Q5JRA6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MIA3Q5JRA6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MIA3Q5JRA6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MIA3Q5JRA6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MIA3Q5JRA6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MIA3Q5JRA6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MIA3Q5JRA6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MIA3Q5JRA6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MIA3Q5JRA6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MIA3Q5JRA6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MIA3Q5JRA6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MIA3Q5JRA6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MIA3Q5JRA6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MIA3Q5JRA6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MIA3Q5JRA6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MIA3Q5JRA6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MIA3Q5JRA6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MIA3Q5JRA6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MIA3Q5JRA6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MIA3Q5JRA6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MIA3Q5JRA6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MIA3Q5JRA6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MIA3Q5JRA6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MIA3Q5JRA6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MIA3Q5JRA6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MIA3Q5JRA6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MIA3Q5JRA6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MIA3Q5JRA6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MIA3Q5JRA6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MIA3Q5JRA6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MIA3Q5JRA6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MIA3Q5JRA6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MIA3Q5JRA6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MIA3Q5JRA6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MIA3Q5JRA6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MIA3Q5JRA6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MIA3Q5JRA6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MIA3Q5JRA6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MIA3Q5JRA6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MIA3Q5JRA6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MIA3Q5JRA6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MIA3Q5JRA6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MIA3Q5JRA6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MIA3Q5JRA6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MIA3Q5JRA6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MIA3Q5JRA6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MIA3Q5JRA6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MIA3Q5JRA6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
MIA3Q5JRA6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MIA3Q5JRA6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MIA3Q5JRA6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MIA3Q5JRA6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MIA3Q5JRA6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms