Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYW3

RTL5, Retrotransposon Gag-like protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL5Q5HYW3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RTL5Q5HYW3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RTL5Q5HYW3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RTL5Q5HYW3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RTL5Q5HYW3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RTL5Q5HYW3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RTL5Q5HYW3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RTL5Q5HYW3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RTL5Q5HYW3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RTL5Q5HYW3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RTL5Q5HYW3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RTL5Q5HYW3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RTL5Q5HYW3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RTL5Q5HYW3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RTL5Q5HYW3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RTL5Q5HYW3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RTL5Q5HYW3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RTL5Q5HYW3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RTL5Q5HYW3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RTL5Q5HYW3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RTL5Q5HYW3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RTL5Q5HYW3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
RTL5Q5HYW3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RTL5Q5HYW3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RTL5Q5HYW3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RTL5Q5HYW3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RTL5Q5HYW3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RTL5Q5HYW3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RTL5Q5HYW3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
RTL5Q5HYW3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RTL5Q5HYW3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RTL5Q5HYW3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RTL5Q5HYW3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
RTL5Q5HYW3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RTL5Q5HYW3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RTL5Q5HYW3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RTL5Q5HYW3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RTL5Q5HYW3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RTL5Q5HYW3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RTL5Q5HYW3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RTL5Q5HYW3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RTL5Q5HYW3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RTL5Q5HYW3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RTL5Q5HYW3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RTL5Q5HYW3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RTL5Q5HYW3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RTL5Q5HYW3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RTL5Q5HYW3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RTL5Q5HYW3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
RTL5Q5HYW3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
RTL5Q5HYW3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
RTL5Q5HYW3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RTL5Q5HYW3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RTL5Q5HYW3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RTL5Q5HYW3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RTL5Q5HYW3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RTL5Q5HYW3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RTL5Q5HYW3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
RTL5Q5HYW3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RTL5Q5HYW3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RTL5Q5HYW3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RTL5Q5HYW3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RTL5Q5HYW3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RTL5Q5HYW3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RTL5Q5HYW3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RTL5Q5HYW3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RTL5Q5HYW3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
RTL5Q5HYW3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
RTL5Q5HYW3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RTL5Q5HYW3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RTL5Q5HYW3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RTL5Q5HYW3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RTL5Q5HYW3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RTL5Q5HYW3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RTL5Q5HYW3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RTL5Q5HYW3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RTL5Q5HYW3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RTL5Q5HYW3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RTL5Q5HYW3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RTL5Q5HYW3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RTL5Q5HYW3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RTL5Q5HYW3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RTL5Q5HYW3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RTL5Q5HYW3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RTL5Q5HYW3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
RTL5Q5HYW3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RTL5Q5HYW3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RTL5Q5HYW3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RTL5Q5HYW3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RTL5Q5HYW3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RTL5Q5HYW3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RTL5Q5HYW3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
RTL5Q5HYW3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RTL5Q5HYW3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RTL5Q5HYW3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RTL5Q5HYW3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RTL5Q5HYW3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RTL5Q5HYW3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RTL5Q5HYW3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RTL5Q5HYW3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms