Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGAP29Q52LW3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGAP29Q52LW3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGAP29Q52LW3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGAP29Q52LW3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARHGAP29Q52LW3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARHGAP29Q52LW3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARHGAP29Q52LW3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARHGAP29Q52LW3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARHGAP29Q52LW3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARHGAP29Q52LW3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARHGAP29Q52LW3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARHGAP29Q52LW3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARHGAP29Q52LW3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ARHGAP29Q52LW3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARHGAP29Q52LW3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARHGAP29Q52LW3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARHGAP29Q52LW3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARHGAP29Q52LW3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARHGAP29Q52LW3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARHGAP29Q52LW3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARHGAP29Q52LW3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARHGAP29Q52LW3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARHGAP29Q52LW3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARHGAP29Q52LW3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARHGAP29Q52LW3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARHGAP29Q52LW3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARHGAP29Q52LW3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ARHGAP29Q52LW3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms